Was geschieht eigentlich mit organischen Substanzen in Boden oder Wasser? Nach welchen Regeln werden diese mikrobiell abgebaut? Wie verhalten sich neuentwickelte Substanzen in der Umwelt? Kann man zu deren Verhalten schon frühzeitig Aussagen treffen? Dem Umweltwissenschaftler sind die grundlegenden Mechanismen der Biokatalyse und Biodegradation bekannt. Manchmal benötigt man aber doch weitergehende Informationen aus einschlägigen aktuellen Datenbanken. Auch wer nicht so eng mit der Materie vertraut ist, wird manchmal wissen wollen, wie spezielle Mechanismen ablaufen, ohne sich in dicke Bücher einlesen zu müssen.
Hier ist ein Blick auf die Internetseite der Biocatalysis/Biodegradation Database der Universität von Minnesota (UM-BBD) lohnenswert. Sie liefert sorgfältig gesammelte und gut aufbereitete Informationen zur mikrobiellen Katalyse und verwandter Biotransformationen zu umweltrelevanten chemischen Substanzen.
Schnörkellos aufgebaut besticht die Hauptseite durch ihre ßbersichtlichkeit und schnelle Verzweigungsmöglichkeiten zu anderen Informationsquellen. Sie verspricht nicht viel, hält aber alle für die aktuelle Arbeit erforderlichen Informationen bereit:
Im Hauptmenü kann man sich über Sinn und Zweck der Datenbank informieren (About the UM-BBD), Neuigkeiten über mehrere Jahre gestaffelt abrufen (What´s New) und natürlich auch das übliche Frage- und Antwort-Spiel (FAQs) betreiben. Eine hervorragende, erweiterbare Suchfunktion (Search) stillt den Wissenshunger auch zu entlegenen Details. Allein der Besuch der Einführung (Guided Tour), des ausführlichen Literaturverzeichnisses zum Thema (Publications), z. T. mit sehr detaillierten, online verfügbaren Zeitschriftenartikeln und der beeindruckenden Internetadressen (Useful Internet Resources) ist einen Besuch der Seite wert.
Etwas unterhalb dieses Hauptmenüs geht es dann in die Details. Das Verzeichnis der allgemeinen und speziellen Abbauwege einschließlich der notwendigen Zwischenschritte (Pathways and Metapathways in the UM-BBD) enthält derzeit Details zu 147 Substanzen (von Acetylene (an/aerobic) bis zu p-xylene), 958 Reaktionen, 902 Verbindungen, 610 Enzymen, 346 Mikroorganismen und viele weitere Detailinformationen.
Traditionell hat sich die UM-BBD vorrangig mit dem Metabolismus organischer Verbindungen (Schwerpunkt organische Metall- und Metalloidverbindungen sowie toxische Schwermetalle) befasst. Aus den vorliegenden Projekten wurde im Lauf der Zeit eine Datenbank, die weit über diesen Rahmen hinausging. Der mikrobielle Abbau organischer Funktionsgruppen kann nunmehr in einem gewissen Grad vorausgesagt werden. Die hierzu erforderlichen Werkzeuge sind als sog. “Pathway Prediction System (PPS)” integrierter Bestandteil der Datenbank.
Auch in Zukunft wird man chemische Substanzen schneller synthetisieren, als deren Umweltverhalten untersucht werden kann. Die in die Datenbank integrierten Vorhersageinstrumente erlauben es, den schon bekannten Abbau ähnlicher Strukturen nachvollziehen und somit gewisse Vorhersagen über das Abbauverhalten neuer Substanz zu treffen.
Für Fachleute, die sich mit Fragen der Biokatalyse und Biodegradation befassen ein unbedingtes Muss. Auch derjenige, der sich in die Thematik noch einzuleben hat, oder auch nur schnuppern möchte, wird die dargebotenen Informationen zu schätzen wissen.
Daher: Für Recherchen in diesem Forschungsbereich der Umweltwissenschaft unbedingt zu Favoriten, Bookmarks, Lesezeichen hinzufügen:
http://umbbd.ahc.umn.edu/
Klaus G. Mross
